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下村脩(2008年诺贝尔化学奖得主)

来自VeritasWiki 真理百科
下村脩
Osamu Shimomura
出生 1928年8月27日
日本京都府福知山市
逝世 2018年10月19日(90岁)
日本长崎市
国籍 日本
母校 长崎医科大学
名古屋大学(博士)
知名于 发现绿色荧光蛋白(GFP)
水母发光机制研究
奖项 诺贝尔化学奖(2008)
朝日奖(2007)
研究领域 生物化学、发光生物学、海洋生物学
机构 普林斯顿大学
伍兹霍尔海洋生物学实验室
名古屋大学
波士顿大学
配偶 下村明美(Akemi Shimomura)
子女 1子1女

生平

下村脩(Osamu Shimomura)于1928年8月27日出生于日本京都府福知山市的一个军人家庭。他的父亲是一名陆军军官,因此家庭常因父亲的调动而搬迁。1945年,第二次世界大战结束时,下村正在长崎——他亲历了原子弹爆炸的恐怖。当时他就读于长崎医科大学附属药学专门部,虽然距爆炸中心约三公里,但幸运地幸存下来。这段经历影响了他后来对生命的思考。

战后,下村在长崎医科大学(现长崎大学药学部)继续学习,1951年毕业。随后他在名古屋大学有机化学专业攻读研究生,师从平田義正(Yoshimasa Hirata)教授,并于1960年获得博士学位。在这里,他开始了一个改变生物学史的课题——研究一种名为"海萤"的甲壳动物的发光机制。

1960年,下村被派往美国普林斯顿大学进行合作研究。在那里,他遇到了普林斯顿大学的弗兰克·约翰逊(Frank Johnson)教授——一位研究海洋生物发光的先驱。此后数十年,下村一直与约翰逊合作,将研究重点聚焦于一种来自日本西海岸的发光水母——维多利亚多管发光水母(Aequorea victoria)。

1982年起,下村正式加入伍兹霍尔海洋生物学实验室(Marine Biological Laboratory, Woods Hole)担任高级科学家,同时在波士顿大学兼任教授。他直到90岁仍在坚持研究工作。

学术生涯

下村的学术生涯可以用"慧眼如炬"来形容。在20世纪50年代末,当他开始研究水母发光现象时,完全没有人预料到这项研究会引出生物学史上最重要的工具之一。

下村最初的研究对象是海萤(Vargula hilgendorfii),这是一种生活在日本沿海的发光甲壳动物。他成功地从海萤中分离出了发光物质——海萤荧光素(luciferin)和催化氧化反应的酶——海萤荧光素酶(luciferase)。这项工作为他赢得了博士学位。

1961年,下村在华盛顿州的星期五港(Friday Harbor)收集了上万只维多利亚多管发光水母。他在实验室里小心地切下水母的发光边缘(称为"伞膜"),然后提取其中的发光物质。经过艰苦的工作,下村发现水母的发光不需要像海萤那样加入荧光素——水母自身合成了某种特殊的发光蛋白。

1962年,下村从水母中纯化出一种在钙离子存在下发出蓝绿色光(波长约470纳米)的蛋白质,并将其命名为"水母素"(aequorin)。更重要的是,他注意到在纯化过程中,含有水母素的溶液在紫外线下会发出亮绿色的荧光。他正确地将这种绿色荧光归因于另一种蛋白质——即后来震惊世界的"绿色荧光蛋白"(Green Fluorescent Protein, GFP)。

获奖成就

2008年,下村脩与马丁·查尔菲(Martin Chalfie)和钱永健(Roger Y. Tsien)共同获得诺贝尔化学奖,表彰他们"发现和改造了绿色荧光蛋白(GFP)"。下村一人获得一半奖金,查尔菲和钱永健各获得四分之一。

诺贝尔奖官方网站的描述指出:"下村脩首先从水母中分离出了GFP,并证明了它在紫外光下发出绿光。这是整个GFP研究的基础。"这是对下村作为发现者地位的最高肯定。

然而,下村的诺贝尔之路颇为漫长——他的发现是在1962年做出的,但直到46年后的2008年才获得诺贝尔奖。部分原因是早期的生物学界并未充分认识到GFP的潜力。下村的其他荣誉包括:2007年朝日奖、2008年获得日本文化功劳者和文化勋章。

历史贡献

下村脩最核心的贡献是发现并初步表征了绿色荧光蛋白(GFP)。

    • 1. GFP的发现(1962年)**:下村从维多利亚多管发光水母中纯化出GFP,并发现该蛋白质在受到紫外线或蓝光照射时会发出明亮的绿色荧光(发射峰值在509纳米处)。他正确地将此归因于蛋白质内部的一个发色团——由三个氨基酸(丝氨酸-酪氨酸-甘氨酸)经过自发环化和氧化反应形成的特殊结构。
    • 2. 水母素(Aequorin)的发现与钙离子传感**:在发现GFP之前,下村就分离出了水母素。他发现这种蛋白质的发光严格依赖于钙离子(Ca²⁺)的存在。这一发现使得水母素本身成为了一种重要的钙离子指示剂,广泛应用于细胞生物学研究中。有趣的是,水母素发出的蓝光恰好可以激发GFP的绿色荧光——水母本身正是利用这种能量转移机制来实现绿色发光的。
    • 3. 变体GFP的获得**:下村后期还从其他海洋生物中发现了其他颜色的荧光蛋白,扩充了这个家族的成员。他持续改进纯化方法,为后续的分子生物学改造奠定了物质基础。
    • 4. 生物发光机理研究**:下村对水母发光体系(包括水母素、GFP和发光体中钙离子的调控作用)进行了系统的生物化学研究,阐明了这一精妙的"光转移"能量共振系统——水母素和GFP之间的生物发光共振能量转移(BRET)机制。

GFP的革命性意义在于:当GFP的基因被转入其他生物(如细菌、蠕虫、小鼠或人类细胞)后,这些生物会在紫外光下自发地发出绿色荧光。这使科学家能够以前所未有的方式"实时观察"活细胞中的蛋白质定位、运动以及基因表达活动。GFP被誉为"21世纪生物学最重要的工具之一"。

轶事典故

    • 亲手采集研究材料**:下村的研究材料——维多利亚多管发光水母——需要到美国西海岸的星期五港野外采集。他在1961年夏天采集了上万只水母,亲手切下发光边缘用于实验。他回忆说:"水母的身体几乎是透明的,切割时需要非常小心。"
    • 用床单提取蛋白质**:在早期缺乏专业层析设备的情况下,下村使用了一种极其原始的方法纯化GFP——他将水母提取液倒在床单上,利用蛋白质在床单上不同速度的移动来完成初步分离。这件轶事成为GFP发现史上最著名的故事之一。
    • 诺贝尔奖迟到46年**:从1962年发现GFP到2008年获得诺贝尔奖,中间隔了整整46年。这期间GFP的价值经历了长时间的沉寂。直到20世纪90年代,随着分子生物学和基因工程技术的发展,GFP的真正威力才被重新发现。
    • 不喜照相机**:下村是一位纯粹的科学家,他一生最大的爱好就是实验。他在老年时期仍坚持每天到实验室工作,曾表示"实验比吃晚饭重要"。他性格十分低调内敛,对媒体的追逐常常感到困惑甚至厌烦。即使在获得诺贝尔奖之后,他也尽力回避公众场合。
    • 诺贝尔演讲中的沉默**:在2008年诺贝尔奖颁奖典礼上,下村的演讲短得出奇。他只简明扼要地陈述了实验事实,没有渲染和修饰,正如他一贯的为人风格。在场听众被他那种"科学的纯粹"深深打动。

参考文献

1. Shimomura, O., Johnson, F. H., & Saiga, Y. (1962). Extraction, purification and properties of aequorin, a bioluminescent protein from the luminous hydromedusan, Aequorea. Journal of Cellular and Comparative Physiology, 59(3), 223-239. 2. Shimomura, O. (1979). Structure of the chromophore of Aequorea green fluorescent protein. FEBS Letters, 104(2), 220-222. 3. Shimomura, O. (2005). The discovery of aequorin and green fluorescent protein. Journal of Microscopy, 217(1), 1-15. 4. Shimomura, O. (2008). Nobel Lecture: Discovery of green fluorescent protein, GFP. 5. 诺贝尔奖官方网站:Osamu Shimomura - Biographical. https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2008/shimomura/facts/ 6. Chalfie, M., & Kain, S. (Eds.). (2006). Green fluorescent protein: properties, applications and protocols. John Wiley & Sons.